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在不依賴參考基因組的情況下對某物種進行基因組測序及拼接組裝,從而繪制該物種的全基因組序列圖譜。
基于小片段文庫的低深度測序數據,通過K-mer分析,從而有效的評估基因組大小、GC含量、雜合度以及重復序列含量等信息
染色體上一些能特定調控mRNA和蛋白質表達水平的區域,其mRNA/蛋白質的表達水平與數量性狀成比例關系。其具體原理是把基因表達量作為一種數量性狀,研究遺傳突變與基因表達的相關性。
利用微流控和 barcode 標記等技術,可一次性捕獲近十萬個細胞,從而獲得大量的轉錄組信息。該過程通量高、成本低、周期短。
對具有參考序列(Reference Sequence)的不同個體,采用WGS方法進行全基因組測序,經生物信息分析,在全基因組范圍內發生的SNPs和InDels進行精確分析。
選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS的目標區域,通過檢測目標區域的序列變異和豐度,以研究環境微生物多樣性及群落組成差異。
可針對樣本中的miRNA、siRNA、piRNA展開全面分析,既能鑒定已知sRNA、也能預測新的sRNA并預測sRNA的靶基因,為研究small RNA功能及調控機制提供有力手段。